十一学校尊重学生的个性化差异，构建了套分层、分类、个性化和多元选择的课程体系。国际部在满足国家必修课程开足开齐的情况下，开设了三个国际课程项目，共开设25门学科课程，包括90多门分层课程。丰富的学术课程包括天文学、海洋科学、经济学、心理学、计算机、统计学、传媒素养、英语文学、世界文化、环境管理、知识理论、音乐理论、视觉艺术等。课程内容覆盖高中基础课程和大学水平的专业课程，支持学生在专业方面深度探索；同时，国际部开设多种综合课程，如职业考查、启明星讲座、小学段、游学、升学指导、学生管理岗位、国际交流等，帮助学生探索个性，开阔视野，从不同视角了解社会和未来。
中美合作国际高中课程（AP）
十一学校的中美合作高中课程（AP）是与美国万山赤中学联合办学，合作方为：北京市十一学校、北京未来城学校和美国万山赤中学。
该项目为中等学历中外合作办学项目，十一学校每年招生100人，未来城学校每年招生50人，招生对象为具有本市中考报考资格的考生并纳入中等学校统一招生计划。学生完成学业、考试合格后可发给北京市普通高中毕业证书和美国高中毕业文凭。
北京未来城学校国际部于2019年开始招生，由十一学校国际部委托培养，在十一共用所有校内资源，未来城项目学费为16万/年，每届计划招生人数约50人。
中英合作剑桥国际高中课程（A-Level）
十一学校于2009年8月开始与英国拉夫堡学校合作承办A-Level项目，每年招生60人，招生对象为具有本市中考报考资格的考生并纳入中等学校统一招生计划。学生完成学业、考试合格后可发给北京市普通高中毕业证书。
国际文凭组织高中课程项目（IBDP）
十一学校与澳大利亚堪培拉文法学校合作举办国际文凭高中(IBDP)课程教育项目。每年招生70人，招生对象为具有本市中考报考资格的考生并纳入中等学校统一招生计划。学生完成学业、考试合格后可发给北京市普通高中毕业证书。
